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Según la etiopatogenia —i.e. según la causa y la fisiopatología consecuente—, las enfermedades se pueden clasificar en:

Enfermedades endógenas (atribuibles a alteración del huésped):
Genéticas
Congénitas
Nutricionales
Metabólicas
Degenerativas
Autoinmunes
Inflamatorias
Endocrinas
Mentales
Enfermedades exógenas (atribuibles al efecto de la acción directa del agente sobre el huésped):
Infecciosas
Parasitarias
Venéreas
Tóxicas
Traumáticas
Alérgicas
Iatrógenas
Enfermedades ambientales (atribuibles a los efectos del ambiente y del agente -en conjunto- sobre el huésped):
Ambientales
Profesionales
Mecanoposturales
Por causa externa
Enfermedades de etiología multifactorial:
Neoplásicas
Del desarrollo
Idiopáticas
Psicosomáticas
Algunas enfermedades llevan el nombre de quien la describió (epónimos):

Véase también: Lista de enfermedades epónimas
Categoría:Enfermedades epónimas

Enfermedad de Alzheimer
Enfermedad de Parkinson